58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3268 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  37.48 
 
 
1645 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  53.33 
 
 
1525 aa  1254    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  44.61 
 
 
2081 aa  889    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  97.82 
 
 
1329 aa  2491    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  100 
 
 
1329 aa  2586    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  91.95 
 
 
1330 aa  2355    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  41.28 
 
 
655 aa  325  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  40.69 
 
 
655 aa  322  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  42.01 
 
 
655 aa  321  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  48.31 
 
 
455 aa  315  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  48.91 
 
 
455 aa  312  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  48.16 
 
 
457 aa  307  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  40.23 
 
 
656 aa  271  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  39.47 
 
 
454 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  43.97 
 
 
336 aa  184  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  36.43 
 
 
563 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  31.84 
 
 
501 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  24.54 
 
 
1454 aa  108  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  24.47 
 
 
1453 aa  106  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  27.21 
 
 
1281 aa  105  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  23.4 
 
 
2222 aa  96.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  26.16 
 
 
1438 aa  94.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.93 
 
 
2912 aa  93.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  23.14 
 
 
2026 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  24.58 
 
 
1276 aa  82.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  30.15 
 
 
688 aa  81.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  27.02 
 
 
2803 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  31.75 
 
 
1538 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  24.44 
 
 
1457 aa  75.1  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  22.94 
 
 
2499 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  33.19 
 
 
1537 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  24.18 
 
 
1036 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  25.88 
 
 
1017 aa  67.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  22.98 
 
 
1916 aa  67.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  25.65 
 
 
902 aa  65.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  24.71 
 
 
1046 aa  65.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  23.68 
 
 
1379 aa  63.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  26.18 
 
 
1009 aa  63.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  27.17 
 
 
939 aa  58.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  23.85 
 
 
1127 aa  57.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  20.83 
 
 
717 aa  55.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  25.87 
 
 
979 aa  55.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  23.61 
 
 
1143 aa  55.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  24.47 
 
 
1017 aa  53.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  27.87 
 
 
1053 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  23.68 
 
 
1848 aa  53.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  24.9 
 
 
711 aa  53.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  24.1 
 
 
1611 aa  52.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  23.74 
 
 
1143 aa  51.6  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  23.41 
 
 
1018 aa  50.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
1038 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  24.05 
 
 
958 aa  48.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  40.51 
 
 
510 aa  46.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  23.45 
 
 
672 aa  46.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  24.76 
 
 
957 aa  46.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.56 
 
 
806 aa  45.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  38.82 
 
 
442 aa  45.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  24.64 
 
 
955 aa  45.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>