60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3077 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  92.11 
 
 
1329 aa  2365    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  45.23 
 
 
2081 aa  899    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  53.22 
 
 
1525 aa  1270    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  100 
 
 
1330 aa  2587    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  91.95 
 
 
1329 aa  2356    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  37.48 
 
 
1645 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  43.25 
 
 
655 aa  321  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  42.74 
 
 
655 aa  321  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  49.28 
 
 
455 aa  320  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  42.39 
 
 
655 aa  318  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  49.88 
 
 
455 aa  318  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  49.14 
 
 
457 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  41.95 
 
 
656 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  39.47 
 
 
454 aa  219  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  43 
 
 
336 aa  182  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  32.63 
 
 
501 aa  149  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  37.03 
 
 
563 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  24.1 
 
 
1454 aa  116  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  23.51 
 
 
2222 aa  112  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  27.57 
 
 
1281 aa  111  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  26.57 
 
 
1438 aa  98.6  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  23.3 
 
 
1453 aa  98.6  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  25.71 
 
 
1457 aa  96.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  24.39 
 
 
1276 aa  92  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  23.89 
 
 
2912 aa  88.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.82 
 
 
2803 aa  85.1  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  23.32 
 
 
2026 aa  85.1  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  29.27 
 
 
688 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  24.7 
 
 
1379 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  31.75 
 
 
1538 aa  80.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  31.85 
 
 
1537 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  22.99 
 
 
2499 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  26.12 
 
 
1009 aa  67.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  22.83 
 
 
1916 aa  68.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  26.88 
 
 
1036 aa  67.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  26.72 
 
 
1053 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  22.43 
 
 
1143 aa  63.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  23.9 
 
 
1127 aa  63.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  24.4 
 
 
1018 aa  62.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.21 
 
 
711 aa  60.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  27.45 
 
 
1611 aa  58.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  27.86 
 
 
1038 aa  56.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  25.05 
 
 
979 aa  56.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  22.73 
 
 
1143 aa  55.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  25.46 
 
 
1017 aa  56.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  26.05 
 
 
1017 aa  54.3  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  24.25 
 
 
672 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  25.64 
 
 
1046 aa  53.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  19.47 
 
 
717 aa  52  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  25.91 
 
 
1691 aa  50.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  22.85 
 
 
1596 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  30.4 
 
 
902 aa  50.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  25 
 
 
901 aa  49.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  23.93 
 
 
1848 aa  48.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.16 
 
 
712 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  39.53 
 
 
510 aa  45.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  21.33 
 
 
709 aa  45.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  38.89 
 
 
442 aa  45.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  25.64 
 
 
939 aa  45.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  24.28 
 
 
1672 aa  45.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>