78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0558 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  47.19 
 
 		 1017 aa  834    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  48.51 
 
 		 1038 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  40.81 
 
 		 1018 aa  669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  42.9 
 
 		 1017 aa  690    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  66.76 
 
 		 1046 aa  1436    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  100 
 
 		 1036 aa  2121    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  38.54 
 
 		 1053 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  34.5 
 
 		 1009 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  41.03 
 
 		 1611 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  39.76 
 
 		 902 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  34.75 
 
 		 955 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  38.15 
 
 		 957 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  34.57 
 
 		 958 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  34.44 
 
 		 958 aa  270  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  42.82 
 
 		 1294 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  39.63 
 
 		 1110 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  37.03 
 
 		 1106 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  31.97 
 
 		 1143 aa  234  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  33.89 
 
 		 1143 aa  219  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  31.19 
 
 		 1457 aa  190  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  27.83 
 
 		 1281 aa  131  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  31.16 
 
 		 901 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  29.21 
 
 		 2222 aa  94.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  27.61 
 
 		 1127 aa  92.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  27.08 
 
 		 2026 aa  92  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  32.44 
 
 		 1276 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  28 
 
 		 2499 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  27.05 
 
 		 1438 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  23.96 
 
 		 1196 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  28.5 
 
 		 1379 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  29.24 
 
 		 1672 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  27.74 
 
 		 1916 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  27.61 
 
 		 1454 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  29.88 
 
 		 1596 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  27.05 
 
 		 688 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  24.18 
 
 		 1329 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  27.93 
 
 		 655 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  27.72 
 
 		 655 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  26.34 
 
 		 939 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  30.14 
 
 		 1330 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  30.89 
 
 		 869 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  27.23 
 
 		 655 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  24.12 
 
 		 2912 aa  67.4  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  27.3 
 
 		 2803 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  26.88 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  25.59 
 
 		 1645 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  29.4 
 
 		 1329 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  25.54 
 
 		 1453 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  26.1 
 
 		 1691 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  26.93 
 
 		 1848 aa  59.3  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  26.93 
 
 		 672 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  24.01 
 
 		 2081 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  27.03 
 
 		 455 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  33.14 
 
 		 1525 aa  55.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  25.63 
 
 		 1521 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1538 aa  53.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  25.3 
 
 		 336 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  28.92 
 
 		 457 aa  51.6  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  28.65 
 
 		 501 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  26.43 
 
 		 319 aa  51.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1537 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23.83 
 
 		 658 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  25.5 
 
 		 315 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  25.5 
 
 		 314 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  23.67 
 
 		 1496 aa  48.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.43 
 
 		 487 aa  48.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  24.1 
 
 		 316 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  26.33 
 
 		 309 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  25 
 
 		 333 aa  46.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  23.67 
 
 		 321 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  27 
 
 		 318 aa  46.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  24.84 
 
 		 317 aa  45.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  34.26 
 
 		 455 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  25 
 
 		 333 aa  45.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  22.83 
 
 		 979 aa  45.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  26.87 
 
 		 656 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  38.64 
 
 		 692 aa  45.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  27.53 
 
 		 309 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>