62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0575 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  45.15 
 
 
1916 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  62.51 
 
 
1848 aa  1072    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  100 
 
 
1127 aa  2266    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  39.47 
 
 
1143 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  39.75 
 
 
1143 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  39.07 
 
 
979 aa  506  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  34.12 
 
 
1457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  39.21 
 
 
869 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  52.38 
 
 
1196 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  41 
 
 
2499 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  37.43 
 
 
1596 aa  366  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  33.78 
 
 
1379 aa  363  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
902 aa  362  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  38.83 
 
 
688 aa  354  5e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  35.48 
 
 
1691 aa  343  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  33.83 
 
 
1276 aa  327  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  40.07 
 
 
901 aa  326  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  35.28 
 
 
1672 aa  318  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  51.36 
 
 
383 aa  318  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  36.62 
 
 
1521 aa  313  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  29.51 
 
 
2026 aa  291  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  29.67 
 
 
1454 aa  268  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  29.15 
 
 
1453 aa  264  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  29.63 
 
 
1438 aa  254  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  31.48 
 
 
672 aa  254  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  32.61 
 
 
1281 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  29.81 
 
 
2222 aa  247  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  31.44 
 
 
955 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  32.41 
 
 
958 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  32.41 
 
 
958 aa  181  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  30.71 
 
 
957 aa  180  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  25.3 
 
 
1611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  22.76 
 
 
2081 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.31 
 
 
2803 aa  94  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  27.61 
 
 
1036 aa  92.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  29.3 
 
 
563 aa  88.6  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  25.49 
 
 
655 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  26.17 
 
 
655 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  27.31 
 
 
2912 aa  75.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  25.1 
 
 
655 aa  75.1  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  27.75 
 
 
1017 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  23.15 
 
 
1053 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  30.58 
 
 
1018 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  29.81 
 
 
1009 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  28.62 
 
 
1046 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  25.39 
 
 
1525 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  27.98 
 
 
939 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  32.31 
 
 
1038 aa  67.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  26.9 
 
 
1017 aa  67.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  27.75 
 
 
457 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  23.54 
 
 
431 aa  61.6  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  23.57 
 
 
1329 aa  60.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  23.68 
 
 
1329 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  23.02 
 
 
1645 aa  59.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  25.57 
 
 
455 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  27.87 
 
 
656 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  23.4 
 
 
1330 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  27.86 
 
 
1289 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  25.32 
 
 
336 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  24.95 
 
 
455 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  37.31 
 
 
176 aa  52.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  29.02 
 
 
454 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>