74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1198 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  89.4 
 
 		 1143 aa  2071    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  100 
 
 		 1143 aa  2317    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  42.77 
 
 		 1916 aa  632  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  39.28 
 
 		 1127 aa  543  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  47.51 
 
 		 1017 aa  502  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  45.87 
 
 		 1018 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  35.98 
 
 		 1457 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  38.04 
 
 		 1848 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  35.3 
 
 		 1276 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  37.22 
 
 		 955 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  37.23 
 
 		 958 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  37.23 
 
 		 958 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  36.81 
 
 		 957 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  39.53 
 
 		 1009 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  34 
 
 		 869 aa  341  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  44.11 
 
 		 1196 aa  327  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  36.49 
 
 		 979 aa  311  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  31.03 
 
 		 1454 aa  299  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  33.45 
 
 		 1453 aa  294  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  31.87 
 
 		 901 aa  290  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  33.57 
 
 		 902 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  34.01 
 
 		 1596 aa  278  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  31.48 
 
 		 1038 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  32.84 
 
 		 1691 aa  264  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  38.34 
 
 		 688 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  36.67 
 
 		 1672 aa  252  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  40.09 
 
 		 1521 aa  248  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  33.88 
 
 		 1053 aa  247  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  34.21 
 
 		 1017 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  28.93 
 
 		 1379 aa  235  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  31.97 
 
 		 1036 aa  234  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  29.56 
 
 		 1281 aa  227  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  31.32 
 
 		 1046 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  30.33 
 
 		 2222 aa  218  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  27.29 
 
 		 1438 aa  204  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  43.93 
 
 		 1294 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  31.33 
 
 		 2026 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  29.82 
 
 		 672 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  26.82 
 
 		 1611 aa  180  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  36.98 
 
 		 1106 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  37.38 
 
 		 1110 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 2499 aa  139  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.13 
 
 		 2803 aa  95.5  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.3 
 
 		 2912 aa  92  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  28.64 
 
 		 939 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  26.17 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  26.23 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  26.21 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  23.32 
 
 		 2081 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  25.07 
 
 		 1525 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  27.21 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  23.4 
 
 		 1329 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  25.05 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  24.53 
 
 		 1330 aa  58.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  30.26 
 
 		 1645 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1289 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  31.69 
 
 		 176 aa  53.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  26.5 
 
 		 454 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  30.86 
 
 		 1496 aa  52.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  23.42 
 
 		 1329 aa  52  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  24.21 
 
 		 656 aa  51.6  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  24.37 
 
 		 429 aa  51.6  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  22.9 
 
 		 650 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  24.05 
 
 		 655 aa  48.5  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.63 
 
 		 650 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  27.45 
 
 		 337 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  24.14 
 
 		 426 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  26.61 
 
 		 326 aa  47.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  26.38 
 
 		 299 aa  46.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  22.19 
 
 		 480 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  34.13 
 
 		 563 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  40.26 
 
 		 431 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  26.6 
 
 		 501 aa  45.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>