60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0580 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  100 
 
 		 869 aa  1753    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  42.21 
 
 		 979 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  39.08 
 
 		 1127 aa  439  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  42.54 
 
 		 1916 aa  435  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  40.68 
 
 		 2499 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  36.24 
 
 		 1848 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  34.62 
 
 		 1143 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  35.39 
 
 		 1143 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  50.54 
 
 		 383 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  33.33 
 
 		 1379 aa  291  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  32.64 
 
 		 2026 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  33.92 
 
 		 1457 aa  276  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  33.63 
 
 		 1276 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  43.24 
 
 		 1196 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  35.08 
 
 		 902 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  38.67 
 
 		 688 aa  249  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  30.96 
 
 		 1438 aa  245  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  34.32 
 
 		 1281 aa  244  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  31.95 
 
 		 1691 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  37.24 
 
 		 901 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  34.15 
 
 		 672 aa  234  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  31.58 
 
 		 2222 aa  225  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  36.04 
 
 		 1596 aa  220  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  32.95 
 
 		 1521 aa  219  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  39.95 
 
 		 1672 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  28.25 
 
 		 1453 aa  197  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  28.93 
 
 		 1454 aa  185  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  30.39 
 
 		 957 aa  159  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  29.58 
 
 		 958 aa  157  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  29.44 
 
 		 958 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  29.12 
 
 		 955 aa  152  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  28.79 
 
 		 1611 aa  124  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  29 
 
 		 2803 aa  107  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  25.91 
 
 		 2081 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  28.6 
 
 		 1053 aa  94  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  28.07 
 
 		 2912 aa  94  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  29.95 
 
 		 1017 aa  88.2  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  29.67 
 
 		 1018 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  28.97 
 
 		 1036 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  28.07 
 
 		 563 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  24.8 
 
 		 1009 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  26.87 
 
 		 1038 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  29.28 
 
 		 1017 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1289 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  25.61 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  24.43 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  23.79 
 
 		 655 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  23.93 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  22.45 
 
 		 1046 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  29.56 
 
 		 457 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  22.98 
 
 		 1525 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  25.93 
 
 		 939 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  24.88 
 
 		 455 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  23.37 
 
 		 655 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  34.92 
 
 		 176 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  24.81 
 
 		 1330 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  24.45 
 
 		 1645 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1837  cytochrome C family protein  29.44 
 
 		 344 aa  48.5  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0334665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  22.76 
 
 		 1329 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  23.14 
 
 		 1329 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>