51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2470 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  57.16 
 
 
1596 aa  1660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  58.13 
 
 
1672 aa  1597    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  51.86 
 
 
1691 aa  1469    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  100 
 
 
1521 aa  3152    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  42.61 
 
 
2803 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  39.77 
 
 
901 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  40.91 
 
 
2912 aa  354  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  39.07 
 
 
1457 aa  346  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  39.87 
 
 
1848 aa  323  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  36.66 
 
 
902 aa  320  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  36.62 
 
 
1127 aa  309  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  37.22 
 
 
688 aa  294  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  34.31 
 
 
1916 aa  263  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  42.42 
 
 
1143 aa  263  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  40.09 
 
 
1143 aa  248  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  30.77 
 
 
672 aa  240  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  37.42 
 
 
1196 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  35.3 
 
 
1276 aa  222  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  32.87 
 
 
979 aa  220  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  33.74 
 
 
958 aa  211  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  32.25 
 
 
955 aa  211  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  33.05 
 
 
958 aa  211  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  37.41 
 
 
869 aa  204  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  32.71 
 
 
957 aa  201  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  43.06 
 
 
1281 aa  189  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  40.28 
 
 
1379 aa  169  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  29.1 
 
 
1453 aa  152  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  29.08 
 
 
1454 aa  151  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  27.46 
 
 
2499 aa  128  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  27.31 
 
 
1611 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  25.8 
 
 
1438 aa  88.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  28.33 
 
 
2026 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  25.28 
 
 
2222 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  23.23 
 
 
1018 aa  63.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  32.6 
 
 
1053 aa  60.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  28.28 
 
 
1038 aa  60.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  25.22 
 
 
1017 aa  58.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  22.23 
 
 
1017 aa  57.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  23.28 
 
 
939 aa  53.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  25.63 
 
 
1036 aa  53.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  27.88 
 
 
1289 aa  52.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  25.09 
 
 
1046 aa  52.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  31.25 
 
 
1106 aa  50.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  26.05 
 
 
1294 aa  50.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  30.47 
 
 
1110 aa  49.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  30.51 
 
 
1009 aa  47.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  30.87 
 
 
455 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  30.85 
 
 
2081 aa  47  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  31.52 
 
 
563 aa  46.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  28.02 
 
 
2178 aa  46.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  27.08 
 
 
1645 aa  45.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>