44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6276 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  100 
 
 
501 aa  977    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  35.35 
 
 
1645 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  35.14 
 
 
1525 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  32.11 
 
 
1330 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  31.87 
 
 
1329 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  31.87 
 
 
1329 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  35.37 
 
 
2081 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  32.86 
 
 
656 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  35.06 
 
 
655 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  34.77 
 
 
655 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  34.2 
 
 
655 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  27.54 
 
 
2803 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  30.79 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  33.16 
 
 
563 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  27.69 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  36.67 
 
 
457 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  25.3 
 
 
1281 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  30.35 
 
 
1454 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  35.29 
 
 
455 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.35 
 
 
2912 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  28.8 
 
 
336 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  27.5 
 
 
1453 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  30.11 
 
 
1053 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  23.54 
 
 
1379 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  23.7 
 
 
1848 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  27.1 
 
 
688 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  28.65 
 
 
1036 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  26.27 
 
 
2026 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  29.79 
 
 
1038 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  24 
 
 
1046 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  25 
 
 
1438 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  25.88 
 
 
2499 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  25.82 
 
 
957 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  26.6 
 
 
1143 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  24.71 
 
 
1457 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  22.77 
 
 
1009 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  24.81 
 
 
939 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  26.56 
 
 
1537 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  23.76 
 
 
902 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  23.66 
 
 
1276 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  29.05 
 
 
1017 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  25.9 
 
 
955 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  29.32 
 
 
901 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  24.18 
 
 
1294 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>