53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3540 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  100 
 
 		 1289 aa  2576    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  42.12 
 
 		 1496 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  37.16 
 
 		 939 aa  337  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  34.11 
 
 		 642 aa  208  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  35.97 
 
 		 672 aa  113  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  40.97 
 
 		 176 aa  78.2  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.44 
 
 		 740 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  32.29 
 
 		 869 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  40.18 
 
 		 1009 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  32.43 
 
 		 979 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  29.21 
 
 		 1848 aa  67.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  29.13 
 
 		 955 aa  63.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.46 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  26.47 
 
 		 1196 aa  59.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  27.86 
 
 		 1127 aa  56.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 688 aa  55.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  31.39 
 
 		 1611 aa  55.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  25.76 
 
 		 1916 aa  53.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  25.74 
 
 		 1143 aa  54.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  28.15 
 
 		 1276 aa  53.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1932  hypothetical protein  29.84 
 
 		 604 aa  53.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 957 aa  53.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  27.88 
 
 		 1521 aa  52.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  25.48 
 
 		 1672 aa  51.6  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  26.95 
 
 		 1143 aa  51.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  28.48 
 
 		 901 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  28.3 
 
 		 1457 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  26.85 
 
 		 958 aa  50.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  26.85 
 
 		 958 aa  50.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  24.8 
 
 		 902 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  50.94 
 
 		 887 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  25.29 
 
 		 2178 aa  49.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  29 
 
 		 1691 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  28.14 
 
 		 1017 aa  49.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 1596 aa  48.5  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  29.44 
 
 		 857 aa  48.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  27.45 
 
 		 2026 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  26.86 
 
 		 943 aa  47.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  31.82 
 
 		 457 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  32.9 
 
 		 455 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  32.46 
 
 		 9585 aa  47.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  27.97 
 
 		 1018 aa  46.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  36.67 
 
 		 455 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  36.67 
 
 		 455 aa  46.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  33.93 
 
 		 920 aa  46.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  32.64 
 
 		 1454 aa  45.8  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  32.26 
 
 		 455 aa  46.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  31.63 
 
 		 841 aa  46.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  41.11 
 
 		 2170 aa  45.4  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  25.62 
 
 		 2222 aa  45.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  30.71 
 
 		 2499 aa  45.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.02 
 
 		 455 aa  45.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  44 
 
 		 836 aa  45.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>