30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1250 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 740 aa  1414    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  69.92 
 
 		 726 aa  948    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1017  cell surface receptor IPT/TIG  40.82 
 
 		 378 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0346067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  24.47 
 
 		 857 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1932  hypothetical protein  26.37 
 
 		 604 aa  68.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.46 
 
 		 1394 aa  68.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  42.06 
 
 		 1134 aa  67.8  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1256  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1742 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.706076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1018  hypothetical protein  40.57 
 
 		 647 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0666768  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  37.03 
 
 		 1695 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.48 
 
 		 859 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2592  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1743 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3471  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.63 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  39.18 
 
 		 1140 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1289 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3409  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.68 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0332  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1066 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.635539  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1357  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1743 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0819282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0325  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.73 
 
 		 597 aa  54.3  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  40.91 
 
 		 2042 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0432  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1002 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.259517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1247  cell surface receptor IPT/TIG  31.79 
 
 		 316 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  31.21 
 
 		 536 aa  48.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  24.88 
 
 		 363 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  35.1 
 
 		 14944 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3736  hypothetical protein  25.89 
 
 		 309 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.127949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  30 
 
 		 665 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.17 
 
 		 247 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  30.99 
 
 		 1821 aa  44.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  29.6 
 
 		 3737 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>