66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3724 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  55.53 
 
 
1672 aa  1855    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  57.29 
 
 
1596 aa  1832    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  100 
 
 
1691 aa  3516    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  51.67 
 
 
1521 aa  1458    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  42.11 
 
 
2803 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  39.45 
 
 
2912 aa  362  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  35.34 
 
 
1127 aa  335  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  34.58 
 
 
1848 aa  330  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  39.85 
 
 
1457 aa  327  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  40.64 
 
 
901 aa  319  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  40.96 
 
 
902 aa  317  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  40.23 
 
 
688 aa  317  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  33.88 
 
 
672 aa  285  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  33.42 
 
 
1143 aa  279  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  33.29 
 
 
1916 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  32.84 
 
 
1143 aa  264  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  32.72 
 
 
979 aa  252  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  42.89 
 
 
1196 aa  251  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  40.25 
 
 
869 aa  227  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  31.14 
 
 
1276 aa  220  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  26.71 
 
 
955 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  27.66 
 
 
958 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  27.56 
 
 
958 aa  197  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  28.06 
 
 
957 aa  190  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  33.02 
 
 
1281 aa  187  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  32.2 
 
 
1379 aa  181  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  31.35 
 
 
1453 aa  155  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  31.54 
 
 
1454 aa  153  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  27.89 
 
 
2222 aa  128  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  26.19 
 
 
1438 aa  111  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  25.25 
 
 
2026 aa  89.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  25.05 
 
 
2499 aa  89.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  26.82 
 
 
1038 aa  84  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  26.45 
 
 
1611 aa  82.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  31.43 
 
 
1017 aa  79.7  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  29.96 
 
 
1018 aa  79.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  29.13 
 
 
1053 aa  73.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  22.94 
 
 
2081 aa  67.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  26.3 
 
 
1046 aa  67.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  25.35 
 
 
1017 aa  63.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  24.86 
 
 
1645 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  29.89 
 
 
1036 aa  60.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  25.45 
 
 
1329 aa  58.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2724  cytochrome c family protein  24.12 
 
 
704 aa  57.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  21.83 
 
 
455 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  31.06 
 
 
431 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  26.09 
 
 
1329 aa  54.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  27.6 
 
 
1009 aa  52  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  25.91 
 
 
1330 aa  52  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  31.22 
 
 
2178 aa  51.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  23.5 
 
 
656 aa  50.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  30 
 
 
1106 aa  50.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  28.03 
 
 
337 aa  50.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  23.75 
 
 
655 aa  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  25.87 
 
 
939 aa  50.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  29 
 
 
1289 aa  49.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  29.17 
 
 
1110 aa  48.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  30.34 
 
 
1294 aa  47  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  23.08 
 
 
1525 aa  47  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  27.75 
 
 
334 aa  46.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  21.74 
 
 
457 aa  46.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  21.27 
 
 
455 aa  45.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  23.48 
 
 
336 aa  45.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  23.88 
 
 
563 aa  45.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  23.1 
 
 
655 aa  45.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  25.37 
 
 
337 aa  45.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>