53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2035 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  57.1 
 
 
1521 aa  1631    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  100 
 
 
1596 aa  3309    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  65.59 
 
 
1672 aa  2145    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  57.29 
 
 
1691 aa  1832    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  41.26 
 
 
2803 aa  383  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  39.73 
 
 
1457 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  40.63 
 
 
901 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  39.3 
 
 
2912 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  37.43 
 
 
1127 aa  363  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  44.31 
 
 
902 aa  356  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  35.08 
 
 
1848 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  44.04 
 
 
688 aa  341  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  35.27 
 
 
1916 aa  301  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  33.53 
 
 
1143 aa  280  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  34.01 
 
 
1143 aa  278  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  32.54 
 
 
672 aa  272  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  34.58 
 
 
979 aa  268  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  38.77 
 
 
1196 aa  268  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  27.64 
 
 
955 aa  235  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  32.19 
 
 
1276 aa  230  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  27.92 
 
 
958 aa  224  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  27.71 
 
 
957 aa  221  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  27.28 
 
 
958 aa  214  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  40.74 
 
 
869 aa  212  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  30.87 
 
 
1281 aa  211  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  29.86 
 
 
1379 aa  191  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  30 
 
 
1454 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  33.68 
 
 
1453 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  27.44 
 
 
2499 aa  127  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  25.95 
 
 
1611 aa  125  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  30.72 
 
 
2222 aa  123  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  29.02 
 
 
2026 aa  109  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  25.74 
 
 
1438 aa  109  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  27.59 
 
 
1018 aa  76.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  29.29 
 
 
1046 aa  76.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  26.06 
 
 
1017 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  22.89 
 
 
1017 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  29.88 
 
 
1036 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  32.39 
 
 
1053 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  23.38 
 
 
1645 aa  64.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  22.8 
 
 
1038 aa  63.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  26.24 
 
 
1009 aa  59.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  26.27 
 
 
939 aa  55.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  24.73 
 
 
2081 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  39.24 
 
 
563 aa  52.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  24.72 
 
 
1289 aa  48.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  23.91 
 
 
1106 aa  48.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  27.49 
 
 
2178 aa  48.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  27.56 
 
 
1110 aa  48.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  22.4 
 
 
1294 aa  46.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  29.65 
 
 
655 aa  46.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  30 
 
 
655 aa  46.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  32.11 
 
 
655 aa  46.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>