61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3563 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  100 
 
 		 1276 aa  2563    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  37.97 
 
 		 1438 aa  555  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  36.25 
 
 		 2222 aa  466  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  36.16 
 
 		 1457 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  35.44 
 
 		 1143 aa  459  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  35.3 
 
 		 1143 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  31.97 
 
 		 2026 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  39.83 
 
 		 955 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  35.29 
 
 		 957 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  35.53 
 
 		 958 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  34.78 
 
 		 1916 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  32.17 
 
 		 1379 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  35.12 
 
 		 958 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  31.25 
 
 		 1454 aa  343  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  31.72 
 
 		 1453 aa  343  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  33.9 
 
 		 1848 aa  335  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  33.37 
 
 		 979 aa  328  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  36.65 
 
 		 902 aa  324  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  33.89 
 
 		 1127 aa  322  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  42.35 
 
 		 901 aa  302  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  38.92 
 
 		 688 aa  280  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  32.64 
 
 		 869 aa  261  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  29.76 
 
 		 1281 aa  245  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  47.32 
 
 		 1196 aa  243  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  32.19 
 
 		 1596 aa  230  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  35.3 
 
 		 1521 aa  222  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  31.14 
 
 		 1691 aa  220  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  30.94 
 
 		 1672 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  29.69 
 
 		 2499 aa  210  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  30.31 
 
 		 672 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  35.25 
 
 		 383 aa  157  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  23.88 
 
 		 2081 aa  130  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  26.22 
 
 		 1611 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  25.88 
 
 		 563 aa  94.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 1009 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.37 
 
 		 2803 aa  85.5  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  32.44 
 
 		 1036 aa  85.5  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  29.95 
 
 		 939 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  24.96 
 
 		 1018 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  25 
 
 		 1017 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  24.67 
 
 		 1525 aa  79.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  28.53 
 
 		 1053 aa  79  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  24.47 
 
 		 1329 aa  75.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  27.39 
 
 		 1017 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  24.13 
 
 		 1329 aa  72.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  28 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  26.82 
 
 		 1038 aa  68.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  28.95 
 
 		 457 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  28.28 
 
 		 655 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  28.28 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  28.02 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  24.39 
 
 		 1645 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  27.84 
 
 		 455 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  25.79 
 
 		 431 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  24.23 
 
 		 2912 aa  54.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1289 aa  53.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1294 aa  52.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  23.06 
 
 		 1330 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  23.67 
 
 		 1046 aa  51.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  33.54 
 
 		 176 aa  50.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  25.48 
 
 		 336 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>