68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3542 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  89.68 
 
 
1454 aa  2637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  100 
 
 
1453 aa  2956    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  33.04 
 
 
1379 aa  522  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  34.38 
 
 
1281 aa  364  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  31.89 
 
 
1276 aa  347  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  31.02 
 
 
1143 aa  309  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  29 
 
 
2026 aa  301  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  27.21 
 
 
1438 aa  300  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  33.45 
 
 
1143 aa  297  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  30.16 
 
 
2222 aa  280  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  30.36 
 
 
1457 aa  272  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  29.45 
 
 
1127 aa  266  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  31.36 
 
 
957 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  31.97 
 
 
955 aa  240  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  32.43 
 
 
1916 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  30.56 
 
 
1848 aa  218  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  27.38 
 
 
979 aa  212  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  35.55 
 
 
901 aa  209  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  28.36 
 
 
869 aa  202  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  36.41 
 
 
1196 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  35.96 
 
 
688 aa  174  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0521  cytochrome C family protein  38.89 
 
 
383 aa  172  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  31.33 
 
 
2803 aa  171  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  31.65 
 
 
2499 aa  171  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  38.48 
 
 
1496 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  33.25 
 
 
672 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  31.73 
 
 
1691 aa  157  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  29.26 
 
 
1521 aa  155  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  28.8 
 
 
1596 aa  155  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  27.12 
 
 
2912 aa  152  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  27.66 
 
 
1611 aa  146  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  30.75 
 
 
1672 aa  129  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  23.67 
 
 
2081 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  29.44 
 
 
902 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  23.09 
 
 
1329 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  22.44 
 
 
1645 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  26.91 
 
 
655 aa  103  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  26.69 
 
 
655 aa  102  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  24.32 
 
 
1329 aa  101  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  27.27 
 
 
655 aa  99  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  23.28 
 
 
1330 aa  98.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  25.6 
 
 
1525 aa  95.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  26.7 
 
 
563 aa  89.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  25.05 
 
 
958 aa  89  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  25.05 
 
 
958 aa  88.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  27 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  27.06 
 
 
455 aa  73.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  26.7 
 
 
1017 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  25.18 
 
 
1053 aa  68.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  28.5 
 
 
1038 aa  65.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  27.06 
 
 
455 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  26.54 
 
 
501 aa  63.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  36.11 
 
 
176 aa  63.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0229  cytochrome C family protein  25.15 
 
 
431 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  27.65 
 
 
454 aa  62.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  24.62 
 
 
1036 aa  62  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  25.86 
 
 
1018 aa  62  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  26.03 
 
 
336 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  25.93 
 
 
1017 aa  60.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  28.31 
 
 
1009 aa  60.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  24.85 
 
 
656 aa  59.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  27.59 
 
 
1538 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  26.47 
 
 
1537 aa  57  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  24.28 
 
 
1046 aa  55.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  23.03 
 
 
939 aa  53.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.81 
 
 
711 aa  52.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  23.69 
 
 
1294 aa  46.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  23.45 
 
 
426 aa  45.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>