62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0581 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  100 
 
 		 2912 aa  5949    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  62.83 
 
 		 2803 aa  3544    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  39.3 
 
 		 1596 aa  370  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  39.18 
 
 		 1691 aa  362  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  39.16 
 
 		 1672 aa  356  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  41.28 
 
 		 1521 aa  339  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  34.49 
 
 		 939 aa  255  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  34.34 
 
 		 2222 aa  239  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  27.66 
 
 		 2026 aa  223  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  25.64 
 
 		 1438 aa  162  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  26.12 
 
 		 1454 aa  157  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  26.59 
 
 		 1453 aa  150  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  31.91 
 
 		 1611 aa  133  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  31.06 
 
 		 1281 aa  132  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  24.55 
 
 		 2499 aa  125  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  25.63 
 
 		 1848 aa  102  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  41.91 
 
 		 1496 aa  101  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  25.86 
 
 		 1329 aa  94.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  26.21 
 
 		 1329 aa  94.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  27.15 
 
 		 655 aa  94.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1284 aa  94  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1538 aa  93.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  27.04 
 
 		 655 aa  93.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  25.3 
 
 		 1143 aa  91.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  29.1 
 
 		 2178 aa  90.1  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  24.05 
 
 		 1143 aa  90.5  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  28.97 
 
 		 1916 aa  90.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1537 aa  90.1  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  26.73 
 
 		 655 aa  90.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  27.16 
 
 		 869 aa  85.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  23.9 
 
 		 2081 aa  84.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  25.22 
 
 		 1525 aa  81.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  23.96 
 
 		 1330 aa  81.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  26.53 
 
 		 688 aa  78.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  27.92 
 
 		 979 aa  76.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  24.79 
 
 		 1276 aa  73.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  27.14 
 
 		 902 aa  70.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  24.53 
 
 		 1379 aa  70.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  23.76 
 
 		 672 aa  70.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  26.04 
 
 		 1457 aa  67.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  24.12 
 
 		 1036 aa  67.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  25.97 
 
 		 1053 aa  66.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  24.79 
 
 		 501 aa  62.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  26.47 
 
 		 1196 aa  60.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  25.61 
 
 		 1645 aa  60.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  26.26 
 
 		 1127 aa  60.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  26.02 
 
 		 901 aa  59.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  25 
 
 		 1009 aa  55.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  26 
 
 		 1294 aa  53.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  25 
 
 		 457 aa  53.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  24.66 
 
 		 454 aa  53.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  29.1 
 
 		 455 aa  52.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  25.79 
 
 		 1046 aa  51.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 455 aa  49.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  24.35 
 
 		 1038 aa  49.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  30.05 
 
 		 336 aa  49.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  24.03 
 
 		 1018 aa  48.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1100  cytochrome C family protein  31.65 
 
 		 321 aa  48.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.103207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  24.1 
 
 		 1017 aa  47.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  24.82 
 
 		 656 aa  47.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  26.49 
 
 		 426 aa  47.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  26.32 
 
 		 955 aa  47  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>