102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2883 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  76.48 
 
 		 688 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  100 
 
 		 902 aa  1812    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  56.55 
 
 		 1457 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  53.44 
 
 		 1038 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  52.19 
 
 		 1017 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  35.71 
 
 		 955 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  34.83 
 
 		 958 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  40.98 
 
 		 1127 aa  363  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  43.81 
 
 		 1596 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  49.88 
 
 		 1294 aa  346  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  37.35 
 
 		 1848 aa  344  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  42.86 
 
 		 1672 aa  342  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  45.5 
 
 		 1110 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  46.92 
 
 		 1106 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  43.29 
 
 		 1276 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  34.34 
 
 		 1046 aa  337  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  34.24 
 
 		 957 aa  333  9e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  40.89 
 
 		 1691 aa  331  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  39.37 
 
 		 1036 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  36.66 
 
 		 1521 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  35.52 
 
 		 1009 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  35.74 
 
 		 1916 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  34.33 
 
 		 958 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  35.62 
 
 		 1018 aa  301  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  34.94 
 
 		 1017 aa  300  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  33.63 
 
 		 1196 aa  297  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  34.46 
 
 		 1143 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  35.78 
 
 		 1053 aa  294  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  33.57 
 
 		 1143 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  38.25 
 
 		 979 aa  253  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  35.57 
 
 		 869 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  36.49 
 
 		 1281 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  33.33 
 
 		 672 aa  209  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  34.31 
 
 		 1379 aa  195  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  27.67 
 
 		 1438 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  30.42 
 
 		 1454 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  27.9 
 
 		 2222 aa  181  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  25.15 
 
 		 2499 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  25.62 
 
 		 1611 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  27.01 
 
 		 2026 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  29.44 
 
 		 1453 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  27.01 
 
 		 2803 aa  88.6  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  26.08 
 
 		 901 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  26.42 
 
 		 1645 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  27.14 
 
 		 2912 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  26.94 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  27.29 
 
 		 939 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  26.44 
 
 		 655 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  24.95 
 
 		 2081 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  25.05 
 
 		 884 aa  61.6  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  26.01 
 
 		 655 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  28.67 
 
 		 457 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  25.14 
 
 		 454 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  36.23 
 
 		 176 aa  56.6  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2724  cytochrome c family protein  28.16 
 
 		 704 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  25.96 
 
 		 329 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  26.79 
 
 		 328 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  27.59 
 
 		 455 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1537 aa  52  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  26.67 
 
 		 1330 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  27.43 
 
 		 333 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  27.43 
 
 		 333 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1289 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  26.05 
 
 		 329 aa  49.7  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  27.83 
 
 		 326 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  24.58 
 
 		 340 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1538 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1857  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 733 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  27.23 
 
 		 314 aa  48.9  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  27.09 
 
 		 563 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  25.71 
 
 		 314 aa  47.8  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 317 aa  47.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  24.78 
 
 		 1496 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  24.07 
 
 		 1525 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  26.03 
 
 		 319 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 333 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  25.74 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  23.93 
 
 		 343 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 329 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 333 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 333 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  25.12 
 
 		 309 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  26.07 
 
 		 333 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  25.63 
 
 		 304 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 329 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1837  cytochrome C family protein  29.94 
 
 		 344 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0334665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  23.75 
 
 		 427 aa  45.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  23.76 
 
 		 501 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  25.35 
 
 		 316 aa  45.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  25 
 
 		 312 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  24.76 
 
 		 315 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  23.49 
 
 		 315 aa  45.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  23.47 
 
 		 316 aa  45.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.97 
 
 		 426 aa  45.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  22.97 
 
 		 362 aa  45.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  23.93 
 
 		 790 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  26.64 
 
 		 322 aa  45.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  27.06 
 
 		 656 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  29.03 
 
 		 336 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>