162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2925 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  100 
 
 		 315 aa  656    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  76.85 
 
 		 317 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  76.21 
 
 		 317 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  71.38 
 
 		 316 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  71.2 
 
 		 316 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  72.12 
 
 		 316 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  71.7 
 
 		 314 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  69.16 
 
 		 312 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  64.78 
 
 		 318 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  65.06 
 
 		 314 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  66.89 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  65.27 
 
 		 315 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  58.33 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  58.41 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  58.75 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  58.1 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  58.2 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  58.02 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  58.1 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  56.62 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  57.8 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  58.53 
 
 		 322 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  56.15 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  58.14 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  56.15 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  55.56 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  55.56 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  55.56 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  56.15 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  56.15 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  57.28 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  57.59 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  59.11 
 
 		 329 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  56.4 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  55.73 
 
 		 321 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  58.01 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  56.25 
 
 		 319 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  58.56 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  56.51 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  56.05 
 
 		 304 aa  363  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  55.34 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  47.02 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  47.3 
 
 		 304 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  49.68 
 
 		 287 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  47.59 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  38.24 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  37.16 
 
 		 317 aa  218  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  42.28 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  41.67 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  41.28 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  40 
 
 		 540 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  40 
 
 		 577 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  36.79 
 
 		 337 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  36.1 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  34.64 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  35.66 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  30.52 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  35.04 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  37.31 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  28.74 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  30.45 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  29.46 
 
 		 658 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  30.83 
 
 		 658 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  28.22 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  29.95 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  33.33 
 
 		 656 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  26.87 
 
 		 658 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  32.67 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  28.22 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  32.67 
 
 		 650 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  29.72 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  28.93 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  28.1 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  29.9 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  34.11 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  29.9 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  28.7 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  30.05 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  35.94 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  30.39 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  35.34 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  30.73 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  28.93 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  28.25 
 
 		 157 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  30.39 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  28.02 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  28.38 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  28.9 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  30.47 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  27.93 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  30.71 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  30.47 
 
 		 154 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.92 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  26.06 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.55 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  30.73 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  27.59 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  28.23 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  28.31 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>