113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1144 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  100 
 
 		 334 aa  690    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  93.71 
 
 		 334 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  79.48 
 
 		 335 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  69.55 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  69.16 
 
 		 337 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  35.54 
 
 		 363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  35.54 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  35.84 
 
 		 577 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  34.04 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  32.22 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  33.44 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  33.95 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  32.93 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  33.94 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  33.03 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  32.42 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  36.71 
 
 		 540 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  33.43 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  35.66 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  32.73 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  34.31 
 
 		 299 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  33.13 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  34.52 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  34.01 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  32.05 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  33.13 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  32.83 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  32.05 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  32.05 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  32.55 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  32.88 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  32.83 
 
 		 321 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  38.46 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  32.72 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  35.48 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  34.88 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  31.72 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  31.72 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  32.04 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  31.72 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  34.92 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  31.75 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  34.77 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  32.84 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  31.61 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  31.17 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  34.41 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  32.75 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  30.57 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  39 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  32.17 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  29.6 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  34.89 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  35.52 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  30.37 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  29.91 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  31.38 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  30.51 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  36.36 
 
 		 259 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  31.18 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  32.22 
 
 		 646 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  30.58 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  31.02 
 
 		 656 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.04 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  31.87 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  29.59 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.65 
 
 		 658 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  30.88 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  30.24 
 
 		 427 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  30 
 
 		 658 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  30 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  29.34 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  32.11 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  25.08 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  27.88 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  29.01 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  32.28 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  29.56 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  31.29 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  31.36 
 
 		 153 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  30.82 
 
 		 436 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  30.82 
 
 		 436 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  27.6 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  27.78 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  35.09 
 
 		 440 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  28.4 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  31.76 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  29.38 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  30.22 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  24.65 
 
 		 289 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  30.22 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  27.75 
 
 		 1691 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  30.43 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  25.74 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  24.86 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  25.13 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  29.69 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  24.15 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  25.13 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>