51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0108 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  624  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  95.79 
 
 
309 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  95.15 
 
 
309 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  67.89 
 
 
302 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  33.57 
 
 
610 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2077  hypothetical protein  28.49 
 
 
260 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  24.36 
 
 
658 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  26.71 
 
 
658 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0286  hypothetical protein  25.4 
 
 
240 aa  52.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.046766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  24.12 
 
 
658 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  26.26 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  24.35 
 
 
656 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  24.74 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  25.86 
 
 
650 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  25.52 
 
 
650 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  24.03 
 
 
285 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  26.53 
 
 
646 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  27.51 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  24.81 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  23.3 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  22.18 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  22.85 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  23.75 
 
 
317 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  29.33 
 
 
600 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  22.26 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3093  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  28.48 
 
 
151 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  25.24 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.81 
 
 
487 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  25.74 
 
 
334 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  22.71 
 
 
427 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.53 
 
 
426 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2988  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  34.67 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.02 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  24.08 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  25.1 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  22.89 
 
 
790 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1100  cytochrome c nitrate reductase, small subunit  26.77 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  27.13 
 
 
1036 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  27.18 
 
 
429 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  25.23 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  28.96 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.71 
 
 
426 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  26.2 
 
 
577 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  26.45 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  23.73 
 
 
656 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  24.46 
 
 
449 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  28.99 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  22.22 
 
 
711 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2903  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase (NrfH) precursor  40.98 
 
 
151 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  23.55 
 
 
299 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  29.41 
 
 
621 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>