161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3828 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  100 
 
 
307 aa  634    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  38.06 
 
 
577 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  39.78 
 
 
540 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  36.53 
 
 
363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  34.26 
 
 
337 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  34.87 
 
 
304 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  35.74 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  34.36 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  33.65 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  35.32 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  31.6 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  35.31 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  33.44 
 
 
314 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  31.6 
 
 
333 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  31.6 
 
 
333 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  31.6 
 
 
333 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  35.2 
 
 
334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  33.76 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  37.23 
 
 
312 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  37.31 
 
 
315 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  32.69 
 
 
326 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  31.29 
 
 
333 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  31.27 
 
 
321 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  30.48 
 
 
321 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  37.93 
 
 
316 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  33.21 
 
 
326 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  31.42 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  30.06 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  30.19 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  30.5 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  30.16 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  30.16 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  30.5 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  32.33 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  30.06 
 
 
329 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  30.06 
 
 
329 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  32.93 
 
 
315 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  30.5 
 
 
321 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  32.1 
 
 
333 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  36.12 
 
 
314 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  35.98 
 
 
309 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  32.7 
 
 
329 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  32.82 
 
 
337 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  31.29 
 
 
329 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  34.82 
 
 
316 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  32.24 
 
 
319 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  31.48 
 
 
306 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  35.88 
 
 
317 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  31.65 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  35.06 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  31.37 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  34.66 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  32.88 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  36.47 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  33.33 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  33.33 
 
 
286 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  32.17 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  33.96 
 
 
287 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  28.66 
 
 
310 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  27.33 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  30.5 
 
 
646 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  31.03 
 
 
658 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  29.86 
 
 
658 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  30.41 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  32.16 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  30.58 
 
 
650 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  32.51 
 
 
656 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  30.96 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  31.69 
 
 
650 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.19 
 
 
658 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  29.44 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  27.05 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  29.52 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  30.17 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  32.04 
 
 
449 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  30.36 
 
 
480 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  26.61 
 
 
426 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  28.4 
 
 
436 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  28.29 
 
 
436 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  29.47 
 
 
442 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  28.99 
 
 
429 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  28.51 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  26.52 
 
 
615 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  26.01 
 
 
618 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  27.08 
 
 
436 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  27.87 
 
 
688 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  28.37 
 
 
358 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  28.85 
 
 
384 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  25.97 
 
 
616 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  28.37 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  25.64 
 
 
619 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.83 
 
 
729 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  32.77 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  25.64 
 
 
616 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1384  hypothetical protein  38.3 
 
 
192 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  35.71 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  27.66 
 
 
658 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  24.67 
 
 
618 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  38.04 
 
 
440 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  24.9 
 
 
649 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>