158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2511 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  94.89 
 
 		 333 aa  653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  94.29 
 
 		 333 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  100 
 
 		 329 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  99.7 
 
 		 329 aa  679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  99.7 
 
 		 329 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  94.29 
 
 		 333 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  94.59 
 
 		 333 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  94.59 
 
 		 333 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  89.25 
 
 		 334 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  85.94 
 
 		 333 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  83.59 
 
 		 329 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  82.58 
 
 		 333 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  80.85 
 
 		 328 aa  568  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  81.46 
 
 		 326 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  77.81 
 
 		 329 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  68.83 
 
 		 321 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  67.9 
 
 		 319 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  68.89 
 
 		 321 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  68.89 
 
 		 321 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  69.21 
 
 		 321 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  67.9 
 
 		 321 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  67.17 
 
 		 321 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  67.83 
 
 		 306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  69.54 
 
 		 318 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  63.8 
 
 		 321 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  65.63 
 
 		 319 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  65.2 
 
 		 314 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  68.21 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  64.38 
 
 		 316 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  63.47 
 
 		 316 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  62.04 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  62.86 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  61.73 
 
 		 317 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  62.5 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  61.56 
 
 		 312 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  60 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  59.57 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  58.33 
 
 		 315 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  59.08 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  63.99 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  54.85 
 
 		 310 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  49.84 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  44.91 
 
 		 326 aa  295  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  49.85 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  49.23 
 
 		 286 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  44.14 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  46.38 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  42.76 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  40.42 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  42.62 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  37.37 
 
 		 540 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  36.68 
 
 		 577 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  31.91 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  31.73 
 
 		 363 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  34.88 
 
 		 335 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  31.33 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  34.77 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  33.58 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  35.44 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  32.79 
 
 		 658 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  27.72 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  26.5 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  30.37 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  28.77 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  32.45 
 
 		 656 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  31.49 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  28.03 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  28.11 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  29.01 
 
 		 658 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  28.9 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  26.96 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  29.08 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  32.4 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  32.77 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.71 
 
 		 658 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  32.12 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  31.84 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  33.08 
 
 		 154 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  30 
 
 		 153 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  33.6 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  25.21 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  28.63 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  26.97 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.33 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  31.63 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  31.63 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  31.63 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.63 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.63 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.63 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.63 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.63 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.63 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  29.55 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  31.29 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  27.75 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  28.92 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  27.53 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>