148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1305 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  100 
 
 		 310 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  59.41 
 
 		 304 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  55.38 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  55.69 
 
 		 333 aa  358  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  54.85 
 
 		 329 aa  358  8e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  54.85 
 
 		 329 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  54.85 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  55.21 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  54.49 
 
 		 333 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  54.49 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  54.49 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  54.49 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  54.75 
 
 		 316 aa  351  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  55.62 
 
 		 329 aa  351  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  55.35 
 
 		 333 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  54.17 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  54.29 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  53.58 
 
 		 316 aa  348  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  53.44 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  57.29 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  53.44 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  54.97 
 
 		 319 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  54.17 
 
 		 312 aa  346  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  54.14 
 
 		 309 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  54.97 
 
 		 321 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  59.93 
 
 		 321 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  58.36 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  55.34 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  56.63 
 
 		 322 aa  342  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  54.31 
 
 		 316 aa  342  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  56.73 
 
 		 321 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  56.29 
 
 		 319 aa  342  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  59.57 
 
 		 321 aa  341  8e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  54.95 
 
 		 321 aa  341  9e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  54.95 
 
 		 321 aa  341  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  54.95 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  54.95 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  54.49 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  57.84 
 
 		 314 aa  338  7e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  52.37 
 
 		 334 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  57.63 
 
 		 318 aa  335  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  49.84 
 
 		 304 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  48.04 
 
 		 326 aa  298  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  49.68 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  48.43 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  38.57 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  40.07 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  39.71 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  39.35 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  39.57 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  35.52 
 
 		 540 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  33.87 
 
 		 577 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  31.15 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  31.93 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  30.51 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  32.76 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  29.41 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  29.91 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  30.37 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  35.1 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  29.55 
 
 		 658 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  28.81 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  28.94 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  28.07 
 
 		 646 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  30.98 
 
 		 658 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.64 
 
 		 188 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.07 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.07 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.07 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.07 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  32.56 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  29.84 
 
 		 426 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  30.27 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.79 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  28.45 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  28.1 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  30.77 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  31.01 
 
 		 154 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  30.77 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.79 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  30.38 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  26.55 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.95 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  29.44 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  29.44 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  29.32 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  32.52 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  30.23 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.67 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  30.47 
 
 		 154 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0182  formate-dependent nitrite reductase  29.92 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>