100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03943 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  100 
 
 
188 aa  394  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  100 
 
 
188 aa  394  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  100 
 
 
188 aa  394  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  394  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  100 
 
 
188 aa  394  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  100 
 
 
188 aa  394  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  99.47 
 
 
188 aa  391  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  99.47 
 
 
188 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  99.47 
 
 
188 aa  391  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  88.83 
 
 
188 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  88.83 
 
 
188 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  88.83 
 
 
188 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  88.83 
 
 
188 aa  354  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  88.3 
 
 
188 aa  352  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  75.79 
 
 
189 aa  290  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  74.21 
 
 
189 aa  285  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1998  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.39 
 
 
197 aa  108  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003115  cytochrome c-type protein nrfB precursor  29.95 
 
 
200 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02726  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.48 
 
 
200 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  34.94 
 
 
154 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  35.03 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  30.46 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  32.7 
 
 
153 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  31.03 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  31.29 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  32.34 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  37.19 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  35.48 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  31.38 
 
 
310 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4153  formate-dependent nitrite reductase  31.21 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4285  formate-dependent nitrite reductase  31.21 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0182  formate-dependent nitrite reductase  31.21 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0181  formate-dependent nitrite reductase  31.21 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  32.48 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  33.96 
 
 
329 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  33.67 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  31.28 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  32.31 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  30 
 
 
333 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  31.02 
 
 
329 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  30.69 
 
 
326 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  33.95 
 
 
333 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  33.95 
 
 
333 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  33.95 
 
 
333 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  31.63 
 
 
329 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  33.95 
 
 
333 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  33.17 
 
 
328 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  31.63 
 
 
329 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  33.95 
 
 
329 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  33.95 
 
 
333 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  37.24 
 
 
321 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  36.55 
 
 
321 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  30.77 
 
 
315 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  31.63 
 
 
321 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  31.63 
 
 
319 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  32.72 
 
 
334 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  32.37 
 
 
314 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  32.14 
 
 
309 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  31.12 
 
 
306 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  31.55 
 
 
319 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  31.51 
 
 
318 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  27.81 
 
 
307 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  30.61 
 
 
321 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  30.61 
 
 
321 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  28.57 
 
 
304 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  32.39 
 
 
321 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  31.12 
 
 
321 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  30.37 
 
 
312 aa  55.1  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  28.21 
 
 
314 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  27.81 
 
 
304 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  31.79 
 
 
322 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  30 
 
 
318 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  27.6 
 
 
316 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  27.32 
 
 
315 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  33.74 
 
 
316 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  29.07 
 
 
317 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  27.56 
 
 
299 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  30.32 
 
 
316 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  30.81 
 
 
286 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  28.72 
 
 
317 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  27.23 
 
 
317 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  22.6 
 
 
618 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  22.08 
 
 
616 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  23.53 
 
 
758 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  27.1 
 
 
540 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  27.68 
 
 
259 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  21.43 
 
 
619 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
764 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  29.45 
 
 
670 aa  43.5  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  26.09 
 
 
618 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  27.66 
 
 
287 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  21.43 
 
 
616 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  32.65 
 
 
307 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  24.14 
 
 
615 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  27.75 
 
 
182 aa  41.6  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  24.78 
 
 
577 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  24.82 
 
 
363 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  27.32 
 
 
362 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  26.13 
 
 
315 aa  41.2  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>