162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1207 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  100 
 
 
326 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  83.54 
 
 
333 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  80.78 
 
 
333 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  80.78 
 
 
333 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  80.48 
 
 
333 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  81.6 
 
 
333 aa  566  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  81.46 
 
 
329 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  81.46 
 
 
329 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  81.16 
 
 
329 aa  565  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  80.48 
 
 
333 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  81.4 
 
 
333 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  82.46 
 
 
329 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  80.49 
 
 
334 aa  547  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  79.03 
 
 
328 aa  541  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  78.19 
 
 
329 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  72 
 
 
319 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  65.33 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  65.33 
 
 
321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  64.31 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  70.2 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  65.23 
 
 
321 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  69.87 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  65.23 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  65.54 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  65.23 
 
 
319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  64.92 
 
 
306 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  68.33 
 
 
321 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  62.97 
 
 
314 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  59.38 
 
 
312 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  60.43 
 
 
317 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  62.91 
 
 
316 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  59.82 
 
 
317 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  59.51 
 
 
316 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  59.75 
 
 
316 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  59.33 
 
 
318 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  58.54 
 
 
315 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  56.62 
 
 
315 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  57.96 
 
 
309 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  58.04 
 
 
314 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  62.59 
 
 
304 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  55.21 
 
 
310 aa  335  7e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  47.24 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  45.92 
 
 
326 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  48.47 
 
 
287 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  49.08 
 
 
286 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  43 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  46.38 
 
 
307 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  38.86 
 
 
299 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  42.68 
 
 
315 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  35.84 
 
 
299 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  33.23 
 
 
337 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  32.54 
 
 
337 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  34.04 
 
 
540 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  34.03 
 
 
577 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  35.07 
 
 
335 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  32.33 
 
 
363 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  35.48 
 
 
334 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  31.78 
 
 
334 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  34.94 
 
 
307 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  38.22 
 
 
259 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  31.3 
 
 
658 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  28.62 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  26.59 
 
 
480 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  28.94 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  33.58 
 
 
154 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  31.82 
 
 
658 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.28 
 
 
658 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  30.96 
 
 
646 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  31.49 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  31.09 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  29.08 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.91 
 
 
188 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.91 
 
 
188 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.91 
 
 
188 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.91 
 
 
188 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.22 
 
 
656 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.38 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  33.67 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  33.67 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  28.91 
 
 
650 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.67 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.67 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.67 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.67 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  33.67 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.67 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  33.67 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  27.27 
 
 
650 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  32.2 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  26.61 
 
 
426 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  29.85 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  27.89 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  35.2 
 
 
156 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  29.33 
 
 
434 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.79 
 
 
189 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  33.08 
 
 
154 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  26.88 
 
 
427 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  27.54 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  31.75 
 
 
166 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  26.12 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>