139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1124 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  57.94 
 
 		 646 aa  779    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  100 
 
 		 658 aa  1326    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  48.61 
 
 		 650 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  57.72 
 
 		 658 aa  783    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  48.23 
 
 		 656 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  48.3 
 
 		 650 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  49.44 
 
 		 658 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  33.72 
 
 		 427 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  32.3 
 
 		 426 aa  195  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  35.58 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  35.58 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  36.18 
 
 		 436 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  34.2 
 
 		 429 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  30.08 
 
 		 487 aa  164  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  31.71 
 
 		 449 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  32.21 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  29.84 
 
 		 480 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  36.43 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  33.09 
 
 		 434 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  32.39 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  30.84 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  34.13 
 
 		 374 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  29.65 
 
 		 331 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  30.15 
 
 		 337 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  27 
 
 		 358 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  27.38 
 
 		 384 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 358 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  29.96 
 
 		 370 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  29.14 
 
 		 307 aa  96.3  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  29.97 
 
 		 306 aa  94  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  29.97 
 
 		 321 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  29.97 
 
 		 321 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  29.97 
 
 		 321 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  29.27 
 
 		 321 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  29.62 
 
 		 321 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  28.18 
 
 		 319 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  28.83 
 
 		 326 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  29.27 
 
 		 321 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  37.58 
 
 		 317 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  28.29 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  31.72 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  26.22 
 
 		 312 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  28.77 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  28.63 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  29.86 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  27.21 
 
 		 577 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  27.95 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  27.97 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  27.8 
 
 		 299 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  28.52 
 
 		 322 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  26.03 
 
 		 321 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  29.5 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  26.55 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  31.82 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  29.95 
 
 		 330 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  31.16 
 
 		 318 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  31.14 
 
 		 304 aa  77  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  25.28 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  27.53 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  34.62 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  29.68 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  29.39 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  30.11 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  28.63 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  30.45 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  31.67 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0260  hypothetical protein  35.23 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  24.38 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 363 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  29.01 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  29.01 
 
 		 329 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  33.54 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  27.46 
 
 		 315 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  26.33 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  30.45 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  25.48 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  27.85 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  27.75 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  27.43 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2757  cytochrome C family protein  34.87 
 
 		 201 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  33.86 
 
 		 204 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  31.19 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  24.47 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  30.09 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  26.27 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  27.78 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  30.63 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.53 
 
 		 884 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  30 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.15 
 
 		 712 aa  65.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.78 
 
 		 757 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3161  cytochrome C family protein  39.52 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3223  cytochrome c family protein  34.15 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  24.88 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  22.5 
 
 		 867 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>