147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0361 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  87.06 
 
 		 287 aa  524  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  53.04 
 
 		 316 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  49.55 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  50.62 
 
 		 333 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  51.12 
 
 		 316 aa  285  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  49.54 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  49.54 
 
 		 333 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  49.54 
 
 		 333 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  49.54 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  49.52 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  50.31 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  49.23 
 
 		 329 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  49.23 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  50.16 
 
 		 318 aa  280  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  49.55 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  49.68 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  51.28 
 
 		 317 aa  279  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  48.63 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  49.68 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  48.54 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  49.24 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  49.04 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  49.08 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  49.36 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  49.84 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  51.5 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  49.22 
 
 		 319 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  49.19 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  50.16 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  48.91 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  50.16 
 
 		 309 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  48.6 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  48.91 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  48.29 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  48.6 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  48.29 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  46.97 
 
 		 334 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  49.35 
 
 		 304 aa  265  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  50 
 
 		 322 aa  261  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  47.59 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  49.68 
 
 		 310 aa  258  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  46.3 
 
 		 319 aa  258  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  48.75 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  43.77 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  41.87 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  36.47 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  36.15 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  33.83 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  35.27 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  36.43 
 
 		 540 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  35.61 
 
 		 577 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  33.33 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  31.63 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  30.86 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  31.38 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  30.03 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  31.08 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  41.38 
 
 		 259 aa  89  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  33.94 
 
 		 449 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  29.62 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  28.91 
 
 		 646 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  32.24 
 
 		 426 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  27.49 
 
 		 658 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  29.22 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.81 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  27.75 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  26.91 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  32.54 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  30.35 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  31.13 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  27.1 
 
 		 650 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  27.98 
 
 		 658 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  28.11 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  26.17 
 
 		 650 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  29.21 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.12 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.12 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.12 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  32.12 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  25.98 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  28.26 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  31.61 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  28.8 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  28.8 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  29.35 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  29.35 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.85 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3161  cytochrome C family protein  29.33 
 
 		 201 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  27.62 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  24.11 
 
 		 916 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  42.68 
 
 		 440 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  25 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  26.36 
 
 		 487 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  30.81 
 
 		 188 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  30.81 
 
 		 188 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.81 
 
 		 188 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  30.81 
 
 		 188 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>