112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3118 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  93.71 
 
 		 334 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  100 
 
 		 334 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  78.43 
 
 		 335 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  69.16 
 
 		 337 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  68.66 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  35.64 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  34.84 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  32.63 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  32.11 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  32.93 
 
 		 318 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  34.74 
 
 		 577 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  33.13 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  32.52 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  33.23 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  35.44 
 
 		 540 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  33.84 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  33.84 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  34.64 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  32.43 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  35.4 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  34.69 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  32.42 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  34.68 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  33.9 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  32.23 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  34.5 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  33.13 
 
 		 319 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  32.23 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  31.93 
 
 		 319 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  32.05 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  31.93 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  32.05 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  32.05 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  32.44 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  31.93 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  34.71 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  31.63 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  31.63 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  31.47 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  30.54 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  31.33 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  31.33 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  31.69 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  31.94 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  31.33 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  31.78 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  31.02 
 
 		 329 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  39.5 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  32.68 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  32.17 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  32.75 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  32.4 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  35 
 
 		 307 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  29.51 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  33.11 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  29.54 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  31.15 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  30.86 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  30.15 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  36.31 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  32.8 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  31.19 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  29.85 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  30.77 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  30.73 
 
 		 646 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.65 
 
 		 658 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  30.58 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  29.29 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  30.53 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  30.63 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  30.88 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  28.43 
 
 		 650 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  29.63 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  33.75 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  29.38 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  28.28 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  28.49 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  33.86 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  29.94 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  26.97 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  26.56 
 
 		 436 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  26.56 
 
 		 436 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  37.39 
 
 		 440 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  32.2 
 
 		 153 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  29.31 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  29.47 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  27.59 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  28.42 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  27.54 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  26.14 
 
 		 505 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3223  cytochrome c family protein  28.72 
 
 		 195 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  29.69 
 
 		 270 aa  46.2  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  27.16 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  23.83 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  31.51 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  29.5 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  25.76 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  23.83 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  24.26 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>