91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1440 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  845    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  49.88 
 
 
426 aa  488  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  41.11 
 
 
294 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  45.16 
 
 
279 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  36.17 
 
 
291 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  34.3 
 
 
288 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  33.07 
 
 
245 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  30.66 
 
 
656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  31.4 
 
 
655 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  26.08 
 
 
790 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  24.44 
 
 
600 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  27.42 
 
 
867 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  22.92 
 
 
621 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  26.7 
 
 
620 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  26.7 
 
 
618 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  27.45 
 
 
621 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  24.15 
 
 
664 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  26.41 
 
 
238 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  24.89 
 
 
794 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  24.56 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  26.67 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  25.49 
 
 
265 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  26.55 
 
 
646 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  26.21 
 
 
237 aa  64.3  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  23.92 
 
 
266 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  23.27 
 
 
263 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  25.09 
 
 
258 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  25.19 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  22.84 
 
 
717 aa  59.7  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.42 
 
 
712 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  24.64 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  24.09 
 
 
658 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  24.08 
 
 
487 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  27.35 
 
 
317 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  25.68 
 
 
256 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  24.87 
 
 
709 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  24 
 
 
658 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  25.81 
 
 
429 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  26.81 
 
 
317 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  25.91 
 
 
340 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  25.45 
 
 
258 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  25.89 
 
 
658 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  23.04 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.32 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.54 
 
 
650 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  21.94 
 
 
711 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  27.27 
 
 
306 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  27.27 
 
 
321 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  27.27 
 
 
321 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  27.27 
 
 
321 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  24.87 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.06 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  25.69 
 
 
343 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.64 
 
 
806 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  24.17 
 
 
556 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  27.71 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  23.8 
 
 
650 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  27.27 
 
 
321 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  24.02 
 
 
309 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  26.42 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  24.24 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  25.44 
 
 
557 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  23.23 
 
 
656 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  27.71 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  27.27 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.13 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.96 
 
 
757 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  23.04 
 
 
427 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  25.57 
 
 
884 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  27.23 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  27.16 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  24.22 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  25.95 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  27.66 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  23.55 
 
 
287 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  25.28 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  26.61 
 
 
315 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  24.69 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  26.82 
 
 
615 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  27.27 
 
 
318 aa  44.3  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  26.07 
 
 
334 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  25.6 
 
 
788 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  23.83 
 
 
299 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  31.41 
 
 
181 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  26.92 
 
 
252 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  23.03 
 
 
541 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  23.83 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  23.44 
 
 
1537 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1998  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.29 
 
 
197 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1237  cytochrome c family protein  24.69 
 
 
247 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  25.87 
 
 
280 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>