29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2339 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  568  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  45.93 
 
 
263 aa  258  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  46.01 
 
 
265 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  45.42 
 
 
266 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  42.64 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  42.97 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  40.66 
 
 
258 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  41.28 
 
 
256 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  35.93 
 
 
238 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  38.96 
 
 
237 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0212  hypothetical protein  44.44 
 
 
159 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  26.12 
 
 
426 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  25.36 
 
 
621 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.56 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  25.52 
 
 
600 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  27.04 
 
 
620 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  27.04 
 
 
618 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  26.67 
 
 
621 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  28.89 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  24.9 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  25.35 
 
 
867 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25.79 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  23.05 
 
 
656 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  25.61 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  26.23 
 
 
664 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  33.58 
 
 
607 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  25.5 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  25.23 
 
 
794 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  27.78 
 
 
337 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>