42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0992 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  54.84 
 
 		 279 aa  321  7e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  49.46 
 
 		 426 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  38.97 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  40.42 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  41.11 
 
 		 413 aa  225  9e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  33.1 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  30.13 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  26.83 
 
 		 600 aa  75.5  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  25.51 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  25.19 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  26.52 
 
 		 794 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.13 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  27 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  25.86 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  26.27 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  25.79 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  26.94 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  25.19 
 
 		 620 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  24.68 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  24.83 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  23.65 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  27.13 
 
 		 712 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  25.19 
 
 		 621 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  25.37 
 
 		 618 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  23.92 
 
 		 621 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.89 
 
 		 487 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  25.25 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  32.62 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  27.59 
 
 		 658 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  32.62 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  31.91 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  23.5 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  26.32 
 
 		 658 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  25 
 
 		 867 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  24.51 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0299  hypothetical protein  21.89 
 
 		 627 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  23.18 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  23.05 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  30.08 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2664  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>