66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0451 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1261    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  34.42 
 
 		 664 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  34.01 
 
 		 867 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  33.66 
 
 		 621 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  33.39 
 
 		 620 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  33.06 
 
 		 618 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  30.76 
 
 		 656 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  31.95 
 
 		 600 aa  223  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  31.47 
 
 		 794 aa  213  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  28.13 
 
 		 790 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  30.57 
 
 		 312 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  21.43 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  31.47 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  28.01 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  23.44 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  25.36 
 
 		 272 aa  72  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  25.96 
 
 		 655 aa  71.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  22.39 
 
 		 717 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  26.72 
 
 		 258 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  26.34 
 
 		 238 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  22.96 
 
 		 263 aa  66.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  25.53 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  24.47 
 
 		 658 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  29.61 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  25.99 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  22.78 
 
 		 658 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  28.78 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.84 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  22.5 
 
 		 709 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.14 
 
 		 884 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  24.32 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  24.55 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.04 
 
 		 426 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  22.63 
 
 		 650 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.41 
 
 		 806 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  23.92 
 
 		 294 aa  54.3  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  24.56 
 
 		 646 aa  54.3  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  21.77 
 
 		 658 aa  54.3  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  22.52 
 
 		 650 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  24.75 
 
 		 618 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  27.56 
 
 		 442 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  22.94 
 
 		 258 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  22.35 
 
 		 656 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  24.08 
 
 		 304 aa  50.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0345  hypothetical protein  25.66 
 
 		 644 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  24.15 
 
 		 305 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  22.32 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  22.62 
 
 		 427 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  22.57 
 
 		 618 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  23.71 
 
 		 436 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  23.4 
 
 		 291 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  20.24 
 
 		 1276 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  23.49 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  24.34 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  24.77 
 
 		 1018 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  23.7 
 
 		 436 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  24.57 
 
 		 480 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  25.55 
 
 		 254 aa  44.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  25.35 
 
 		 330 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  25.4 
 
 		 333 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  24.88 
 
 		 288 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  26.07 
 
 		 280 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  26.25 
 
 		 1106 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  25 
 
 		 259 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>