25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1087 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  540  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  57.75 
 
 		 258 aa  328  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  48.61 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  40.61 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  42.97 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  40.46 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  41.26 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  41.5 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  40.08 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  39.92 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0212  hypothetical protein  57.84 
 
 		 159 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  27 
 
 		 600 aa  77  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  31.5 
 
 		 621 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  31.66 
 
 		 618 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  26.6 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  31.66 
 
 		 620 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25.56 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  26.27 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  29.57 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  26.32 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.45 
 
 		 413 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  22.94 
 
 		 621 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  29.1 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  28.43 
 
 		 867 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  24.34 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>