29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0091 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  100 
 
 
256 aa  527  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  55.25 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  49.61 
 
 
258 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  39.46 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  38.38 
 
 
265 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  37.25 
 
 
258 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  37.69 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  37.64 
 
 
266 aa  175  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  36.61 
 
 
238 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  37.85 
 
 
237 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0212  hypothetical protein  46.15 
 
 
159 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  27.34 
 
 
600 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25.4 
 
 
426 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  26.82 
 
 
656 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  28.73 
 
 
621 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  25.52 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  25.74 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.73 
 
 
413 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  29.41 
 
 
867 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  31.21 
 
 
618 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  30.06 
 
 
620 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  30.06 
 
 
621 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25.12 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  22.69 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  26.39 
 
 
794 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  28.11 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  28.07 
 
 
712 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  25.97 
 
 
664 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  25.94 
 
 
646 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>