32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0499 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  57.29 
 
 
288 aa  344  7e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  34.02 
 
 
294 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  39.38 
 
 
279 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  33.57 
 
 
291 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  31.54 
 
 
426 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  33.07 
 
 
413 aa  148  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  30.17 
 
 
656 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  28.77 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  25.76 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  27.44 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  24.11 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  25.48 
 
 
600 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  25.79 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  26.5 
 
 
263 aa  52  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  27.23 
 
 
790 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  25.5 
 
 
272 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  26.19 
 
 
312 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  25.13 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  24.34 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  25.11 
 
 
717 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  33.04 
 
 
449 aa  45.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  25.24 
 
 
867 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  25.77 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  25.1 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  24.71 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  25 
 
 
664 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  27.95 
 
 
709 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  25.36 
 
 
621 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  23.18 
 
 
621 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  30.53 
 
 
330 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  24.27 
 
 
794 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>