34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6650 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  551  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  85.34 
 
 		 265 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  45.42 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  42.55 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  41.95 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  39.92 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  42.62 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  40.62 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  40.43 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  39.08 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0212  hypothetical protein  43.48 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  26.96 
 
 		 600 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  27.12 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.05 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  25.69 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  29.13 
 
 		 794 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  25.99 
 
 		 621 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  23.92 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  25.76 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  26.94 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  26.26 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  29.89 
 
 		 664 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0345  hypothetical protein  27.2 
 
 		 644 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  29.14 
 
 		 618 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  30.39 
 
 		 620 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  28.09 
 
 		 621 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  26.24 
 
 		 655 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0299  hypothetical protein  27.34 
 
 		 627 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  27.13 
 
 		 607 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  23.98 
 
 		 867 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  27.39 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  29.76 
 
 		 417 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  25.38 
 
 		 479 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>