31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6896 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  85.34 
 
 
266 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  46.01 
 
 
272 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  43.75 
 
 
263 aa  226  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  42.86 
 
 
258 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  44.03 
 
 
258 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  40.08 
 
 
258 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  38.38 
 
 
256 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  40.52 
 
 
238 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  45.54 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0212  hypothetical protein  48.05 
 
 
159 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  28.09 
 
 
656 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  25.86 
 
 
600 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  28.01 
 
 
621 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  23.86 
 
 
426 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.49 
 
 
413 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  25.26 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25.86 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  25.48 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  24.11 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  26.72 
 
 
664 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  28.1 
 
 
794 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  25.89 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  30.51 
 
 
618 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  29.38 
 
 
621 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  24.76 
 
 
867 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  30.56 
 
 
620 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  29.3 
 
 
1525 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.09 
 
 
655 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0299  hypothetical protein  29.46 
 
 
627 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  27.01 
 
 
607 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>