45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2851 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  100 
 
 
618 aa  1219    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  96.46 
 
 
621 aa  1119    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  64.77 
 
 
867 aa  752    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  94.68 
 
 
620 aa  1115    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  33.83 
 
 
621 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  34.29 
 
 
664 aa  299  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  31.7 
 
 
794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  31.68 
 
 
600 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  30.37 
 
 
656 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  28.48 
 
 
790 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  27.38 
 
 
413 aa  87  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  28.29 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  33.19 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  32.75 
 
 
309 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  32.75 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  27.04 
 
 
272 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  31.4 
 
 
258 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25.34 
 
 
294 aa  61.6  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  30.16 
 
 
256 aa  60.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  28.37 
 
 
263 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  30.04 
 
 
279 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  25.39 
 
 
650 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  29.36 
 
 
258 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  30.51 
 
 
265 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  27.7 
 
 
258 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  27.14 
 
 
237 aa  53.9  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  29.9 
 
 
238 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.6 
 
 
806 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  23.4 
 
 
658 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  23.69 
 
 
709 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.58 
 
 
711 aa  52.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  29.14 
 
 
266 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  22.64 
 
 
426 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.47 
 
 
884 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  27.12 
 
 
656 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  25.14 
 
 
650 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  26.25 
 
 
288 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.91 
 
 
658 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  25 
 
 
646 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24.1 
 
 
655 aa  47.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  22.65 
 
 
712 aa  47.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  26.34 
 
 
280 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  23.42 
 
 
245 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  25.48 
 
 
291 aa  43.9  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>