29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00342 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  45.93 
 
 		 272 aa  258  7e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  43.75 
 
 		 265 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  42.55 
 
 		 266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  41.44 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  40.46 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  41.95 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  39.31 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  39.62 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  35.77 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0212  hypothetical protein  42.7 
 
 		 159 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  27.55 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  22.96 
 
 		 621 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  25.1 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  23.27 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  25.55 
 
 		 600 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25.51 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  28.37 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  26.69 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  24.68 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  28.35 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  27.88 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  26.39 
 
 		 794 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  26.5 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  27.57 
 
 		 664 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  26.42 
 
 		 867 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  25.14 
 
 		 680 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  25.26 
 
 		 657 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>