12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0588 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 607 aa  1251    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0299  hypothetical protein  45.08 
 
 		 627 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0345  hypothetical protein  40.65 
 
 		 644 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  33.58 
 
 		 272 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  23.98 
 
 		 664 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  33 
 
 		 867 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  24.6 
 
 		 600 aa  45.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  30 
 
 		 346 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  34.83 
 
 		 656 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  27.13 
 
 		 266 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  26.09 
 
 		 426 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  29.14 
 
 		 144 aa  44.3  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>