71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0472 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  100 
 
 
664 aa  1363    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  37.41 
 
 
867 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  34.16 
 
 
621 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  35.47 
 
 
618 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  35.41 
 
 
621 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  35.14 
 
 
620 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  34.19 
 
 
600 aa  249  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  31.21 
 
 
656 aa  243  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  30.03 
 
 
790 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  30.17 
 
 
794 aa  204  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  28.47 
 
 
312 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  31.82 
 
 
299 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  31.82 
 
 
309 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  31.36 
 
 
309 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25.79 
 
 
426 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.05 
 
 
413 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  26.33 
 
 
655 aa  75.5  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  25.08 
 
 
650 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  24.92 
 
 
650 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.33 
 
 
656 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  27.2 
 
 
258 aa  65.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  25.31 
 
 
658 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.59 
 
 
884 aa  62  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  27.18 
 
 
291 aa  61.2  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  25.85 
 
 
265 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  24.02 
 
 
646 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  25 
 
 
294 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  23.77 
 
 
958 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  23.89 
 
 
955 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  23.54 
 
 
658 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  23.77 
 
 
958 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  23.88 
 
 
658 aa  57.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  26.75 
 
 
288 aa  57.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  23.66 
 
 
238 aa  57.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  26.74 
 
 
279 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  23.65 
 
 
487 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  26.23 
 
 
272 aa  54.7  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  28.9 
 
 
266 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  25.1 
 
 
245 aa  53.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  26.44 
 
 
237 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  25.93 
 
 
557 aa  52  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  24.07 
 
 
429 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  26.84 
 
 
263 aa  50.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  32.09 
 
 
610 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.23 
 
 
426 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.8 
 
 
806 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  28.36 
 
 
712 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  22.93 
 
 
957 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  29.73 
 
 
449 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  23.53 
 
 
607 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  24.26 
 
 
280 aa  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  24.26 
 
 
280 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  22.45 
 
 
1009 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  21.89 
 
 
717 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 
304 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  23.7 
 
 
514 aa  47.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  25 
 
 
374 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  24.02 
 
 
330 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  22.7 
 
 
326 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.42 
 
 
436 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.42 
 
 
436 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2849  hypothetical protein  24.26 
 
 
262 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.600753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  23.67 
 
 
252 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  25.97 
 
 
256 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2755  hypothetical protein  23.87 
 
 
262 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1857  fibronectin type III domain-containing protein  25.25 
 
 
733 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  25.81 
 
 
288 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  22.76 
 
 
709 aa  44.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2664  hypothetical protein  24.28 
 
 
262 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  25.4 
 
 
285 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  25 
 
 
312 aa  43.9  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>