69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2189 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  100 
 
 		 600 aa  1229    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  38.31 
 
 		 656 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  34.83 
 
 		 794 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  34.4 
 
 		 664 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  35.74 
 
 		 790 aa  237  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  31.95 
 
 		 621 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  30.41 
 
 		 867 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  31.2 
 
 		 618 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  31.2 
 
 		 620 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  30.98 
 
 		 621 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  24.95 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  35.55 
 
 		 312 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  32.71 
 
 		 309 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  33.04 
 
 		 299 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.59 
 
 		 413 aa  92.8  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  33.77 
 
 		 309 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  24.47 
 
 		 655 aa  78.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  27.76 
 
 		 238 aa  79  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  25.86 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  27 
 
 		 258 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  26.96 
 
 		 266 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  26.83 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  27.01 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  26.77 
 
 		 237 aa  67  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  25.52 
 
 		 272 aa  67  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  27.38 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  26.23 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  25.55 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  27.05 
 
 		 258 aa  62  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  28.14 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  25.48 
 
 		 245 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  28.79 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.06 
 
 		 711 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  22.98 
 
 		 717 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.24 
 
 		 712 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  23.29 
 
 		 709 aa  53.9  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.72 
 
 		 650 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  24.19 
 
 		 650 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  22.3 
 
 		 658 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.3 
 
 		 884 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  23.01 
 
 		 656 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  22.94 
 
 		 658 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0126  hypothetical protein  27.52 
 
 		 309 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  25.89 
 
 		 426 aa  47.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  24.62 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.4 
 
 		 806 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  29.33 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  25.36 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  23.55 
 
 		 335 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  25.36 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  24.56 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  24.51 
 
 		 1106 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  25.36 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  22.28 
 
 		 757 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  25.36 
 
 		 329 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  22.74 
 
 		 658 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  25.36 
 
 		 329 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  24.07 
 
 		 318 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  22.71 
 
 		 284 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  25.36 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  24.6 
 
 		 607 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  23.33 
 
 		 330 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  24.9 
 
 		 321 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  25.18 
 
 		 326 aa  44.3  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  24.9 
 
 		 316 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  21.32 
 
 		 724 aa  43.5  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  24.64 
 
 		 333 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>