26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0670 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  100 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  80.22 
 
 		 289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  58.3 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  59.07 
 
 		 285 aa  291  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  62.56 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  34.18 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  35.43 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  34.81 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  37.45 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  26.29 
 
 		 806 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.86 
 
 		 712 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  29.67 
 
 		 610 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  26.73 
 
 		 658 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  26.23 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  22.98 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  26.98 
 
 		 650 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  28.14 
 
 		 487 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  22.71 
 
 		 600 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  29.22 
 
 		 650 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  26.03 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  26.92 
 
 		 434 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  25 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  29.31 
 
 		 658 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2172  nitrate reductase periplasmic cytochrome c-type protein NapC  27.59 
 
 		 191 aa  43.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.457152  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  24.22 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  25.54 
 
 		 658 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>