51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0471 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  100 
 
 
790 aa  1603    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  32.15 
 
 
656 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  30.69 
 
 
794 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  27.86 
 
 
867 aa  254  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  35.19 
 
 
600 aa  237  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  29.38 
 
 
664 aa  224  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  28.07 
 
 
621 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  27.91 
 
 
620 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  28.24 
 
 
618 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  27.54 
 
 
621 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  30.31 
 
 
426 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  32.18 
 
 
299 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  32.57 
 
 
309 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  29.47 
 
 
655 aa  124  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  32.57 
 
 
309 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  35.32 
 
 
312 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  28.18 
 
 
413 aa  111  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  31.72 
 
 
279 aa  88.6  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  27.55 
 
 
294 aa  77.4  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  26.43 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  27.21 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2644  hypothetical protein  33.55 
 
 
264 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2664  hypothetical protein  29.41 
 
 
262 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.58 
 
 
712 aa  60.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0454  hypothetical protein  30.56 
 
 
182 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2849  hypothetical protein  28.29 
 
 
262 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.600753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2755  hypothetical protein  28.29 
 
 
262 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  22.38 
 
 
717 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  22.85 
 
 
646 aa  55.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  24.02 
 
 
711 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.88 
 
 
806 aa  55.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  27.43 
 
 
245 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  22.56 
 
 
884 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  20.93 
 
 
709 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0568  cytochrome c class III  23.95 
 
 
514 aa  48.9  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  23.84 
 
 
658 aa  47.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  23.5 
 
 
2499 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  24.34 
 
 
658 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  25.49 
 
 
329 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  26.54 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.11 
 
 
650 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  22.19 
 
 
329 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  22.56 
 
 
340 aa  45.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  24.74 
 
 
309 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  23.93 
 
 
902 aa  45.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  23.18 
 
 
958 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  22.89 
 
 
309 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  21.35 
 
 
557 aa  44.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  23.23 
 
 
757 aa  44.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  23.01 
 
 
958 aa  44.3  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  25.51 
 
 
280 aa  44.3  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>