92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2427 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  100 
 
 		 280 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  94.64 
 
 		 280 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  52.42 
 
 		 291 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  50.34 
 
 		 305 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  38.75 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  38.81 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  40.79 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  39.48 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  34.18 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  25.88 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  25.9 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  25.89 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  30 
 
 		 480 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  26.64 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  26.88 
 
 		 806 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  22.39 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  22.75 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  22.7 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  27.17 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  27.07 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  25.95 
 
 		 646 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  25.85 
 
 		 427 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  26.52 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  29.71 
 
 		 658 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  24.44 
 
 		 329 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  24.38 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  25.63 
 
 		 436 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  25 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  26.44 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  24.15 
 
 		 436 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  26.03 
 
 		 426 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  30.95 
 
 		 656 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  24.15 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  26.32 
 
 		 867 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  26.72 
 
 		 487 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  24.85 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  23.95 
 
 		 333 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  23.11 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  30.95 
 
 		 650 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  29.71 
 
 		 650 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  28.09 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  25.68 
 
 		 429 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  24.6 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  27.05 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  26.57 
 
 		 449 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  24.26 
 
 		 664 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  25 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  24.75 
 
 		 717 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  23.6 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  24.27 
 
 		 543 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  24.55 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  22.48 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  24.03 
 
 		 322 aa  45.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  22.48 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  25.28 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  23.5 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  25.28 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  24.14 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.33 
 
 		 884 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  22.39 
 
 		 655 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  24.75 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  25 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  23.66 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  24.52 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  27.33 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  25.17 
 
 		 658 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  28.36 
 
 		 440 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  27.33 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  26.32 
 
 		 658 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  23.73 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  22.15 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  27.33 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  22.15 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  30.51 
 
 		 812 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  23.31 
 
 		 578 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  23.37 
 
 		 340 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  29.32 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  25.87 
 
 		 413 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  28.78 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.29 
 
 		 712 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  28.26 
 
 		 1106 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  29.01 
 
 		 610 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  25.6 
 
 		 340 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  25.21 
 
 		 709 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  20.85 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  23.29 
 
 		 618 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  26.67 
 
 		 621 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  25.2 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  20.85 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  26.05 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  28.99 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  25.33 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>