24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0641 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  67.42 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  66.29 
 
 		 288 aa  346  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  59.33 
 
 		 284 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  59.18 
 
 		 289 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  38.81 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  39.57 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  38.14 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  37.71 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  27.53 
 
 		 884 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  23.49 
 
 		 479 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  30.36 
 
 		 650 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  25.18 
 
 		 427 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  29.35 
 
 		 656 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  31.29 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  25.7 
 
 		 806 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  23.42 
 
 		 621 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  26.67 
 
 		 487 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.93 
 
 		 426 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  25.6 
 
 		 346 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  26.57 
 
 		 340 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  22.9 
 
 		 658 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  25.91 
 
 		 340 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1492  hypothetical protein  28.37 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.198935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>