42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2839 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  100 
 
 		 289 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  80.22 
 
 		 284 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  57.73 
 
 		 288 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  58.49 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  57.36 
 
 		 288 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  38.75 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  39.1 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  38.78 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  36.8 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.44 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  28.17 
 
 		 610 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  25.76 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.1 
 
 		 656 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  25.1 
 
 		 650 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  24.63 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  25.29 
 
 		 689 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  27.64 
 
 		 650 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  26.51 
 
 		 884 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  24.71 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  24 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  28.41 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  26.38 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  26.16 
 
 		 656 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  24.44 
 
 		 712 aa  45.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  25.17 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  30.34 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  25.12 
 
 		 806 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  26.12 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  24.51 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  27.05 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  24.46 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  31.47 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  28.19 
 
 		 658 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  27.15 
 
 		 658 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  23.26 
 
 		 621 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  23.44 
 
 		 340 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  27.75 
 
 		 333 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  23.24 
 
 		 600 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  30.28 
 
 		 436 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  30.28 
 
 		 436 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  30.07 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>