40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0584 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  94.72 
 
 		 288 aa  487  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  65.4 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  57.99 
 
 		 289 aa  308  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  58.05 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  37.64 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  38.19 
 
 		 280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  38.21 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  26.95 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  22.13 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  25.76 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  26.76 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  23.88 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  28.12 
 
 		 658 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  25.11 
 
 		 650 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.75 
 
 		 806 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  22.86 
 
 		 712 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  25.1 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  26.42 
 
 		 429 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  26.16 
 
 		 426 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.36 
 
 		 884 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  25.2 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  25.38 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  27.14 
 
 		 646 aa  46.2  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  27.07 
 
 		 658 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  23.94 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.33 
 
 		 656 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.6 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  23.51 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  23.81 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  24.54 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  25.59 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  30.21 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  25.4 
 
 		 664 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  26.16 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  27.41 
 
 		 658 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  26.19 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  25.64 
 
 		 436 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>