29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0825 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  100 
 
 		 305 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  74.92 
 
 		 291 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2427  multihaem cytochrome  50.34 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  52.94 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  38.78 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0641  hypothetical protein  38.14 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000513772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  38.98 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  37.93 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  37.45 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  25.77 
 
 		 658 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  27.51 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  26.67 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  25.61 
 
 		 711 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  24.68 
 
 		 806 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  24.24 
 
 		 621 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  25.82 
 
 		 717 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0115  hypothetical protein  25.11 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  27.32 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  25.88 
 
 		 616 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  22.66 
 
 		 479 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  27.32 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  22.81 
 
 		 712 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 884 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  25.1 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  26.16 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  22.35 
 
 		 616 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  26.02 
 
 		 436 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  24.78 
 
 		 658 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  22.17 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>