110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2381 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  100 
 
 
315 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  36.47 
 
 
333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  36.12 
 
 
329 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  36.42 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  44.3 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  35.31 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  36.11 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  36.11 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  35.78 
 
 
333 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  42.68 
 
 
326 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  35.47 
 
 
333 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  35.47 
 
 
333 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  35.47 
 
 
333 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  35.47 
 
 
333 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  34.94 
 
 
321 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  37.06 
 
 
312 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  33.64 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  40.93 
 
 
329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  34.45 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  41.28 
 
 
315 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  36.89 
 
 
316 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  35.71 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  34.57 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  36.01 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  35.74 
 
 
314 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  41.38 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  34.39 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  35.28 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  33.64 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  35.38 
 
 
316 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  39.66 
 
 
321 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  38.26 
 
 
307 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  32.72 
 
 
321 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  32.41 
 
 
321 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  33.66 
 
 
304 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  38.36 
 
 
319 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  38.79 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  38.79 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  38.79 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  38.79 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  39.22 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  39.5 
 
 
316 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  34.82 
 
 
317 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  37.6 
 
 
299 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  31.4 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  37.21 
 
 
577 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  35.85 
 
 
287 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  36.92 
 
 
540 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  39.57 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  34.91 
 
 
286 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  34.87 
 
 
299 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  32.59 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  35.66 
 
 
363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  35.48 
 
 
337 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  39.5 
 
 
334 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  34.41 
 
 
337 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  39 
 
 
334 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  32.93 
 
 
307 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  32.79 
 
 
335 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  40.88 
 
 
259 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  31.35 
 
 
646 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  28.73 
 
 
658 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  36.31 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  38.76 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  31.34 
 
 
650 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  30.26 
 
 
658 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  27.17 
 
 
656 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  26.38 
 
 
650 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  28.64 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  29.47 
 
 
436 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.95 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  29.47 
 
 
436 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  33.13 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  33.75 
 
 
658 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  29.5 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  27.07 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  38.05 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  29.59 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  25.33 
 
 
426 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  29.8 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3114  cytochrome C family protein  32.57 
 
 
440 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.95 
 
 
487 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  30.05 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  29.83 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  28.76 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  32.31 
 
 
384 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  32.31 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  32.31 
 
 
358 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  23.28 
 
 
1601 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  30.86 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  29.03 
 
 
331 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  28.57 
 
 
372 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3161  cytochrome C family protein  24.48 
 
 
201 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  29.92 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3111  cytochrome C family protein  30.88 
 
 
204 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3223  cytochrome c family protein  31.54 
 
 
195 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.591925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.4 
 
 
757 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2757  cytochrome C family protein  38.6 
 
 
201 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0260  hypothetical protein  24.58 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.57 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>