71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1577 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  100 
 
 
372 aa  773    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  54.37 
 
 
350 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  58.33 
 
 
349 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2712  hypothetical protein  48.99 
 
 
366 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  45.08 
 
 
359 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  46.85 
 
 
359 aa  325  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  23.18 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  22.73 
 
 
619 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  28.15 
 
 
540 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  23.08 
 
 
618 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  25.73 
 
 
618 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  26.87 
 
 
577 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  28.24 
 
 
658 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  28.04 
 
 
346 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  27.81 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  27.81 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  27.81 
 
 
333 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  27.14 
 
 
319 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  28.23 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  28.74 
 
 
307 aa  53.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  28.23 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  27.81 
 
 
333 aa  53.1  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  27.86 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  28.23 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  27.87 
 
 
615 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  28.82 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  31.21 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  28.23 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  28.26 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  27.22 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  28.23 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  28.23 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  27.86 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  28.82 
 
 
329 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  28.82 
 
 
329 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  26.76 
 
 
616 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  26.76 
 
 
616 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  28.02 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  28.82 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  28.23 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  27.32 
 
 
333 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  27.42 
 
 
321 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  28.24 
 
 
334 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  25 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  29.29 
 
 
312 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  27.86 
 
 
317 aa  49.7  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  28.57 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  28.82 
 
 
328 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  29.29 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  28.37 
 
 
729 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  27.46 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  32.17 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  29.41 
 
 
211 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  24.54 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3967  formate-dependent nitrite reductase  27.61 
 
 
156 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  27.42 
 
 
304 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  27.49 
 
 
346 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  27.49 
 
 
346 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  29.56 
 
 
307 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  27.49 
 
 
346 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  27.14 
 
 
316 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  26.61 
 
 
322 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  26.51 
 
 
154 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  24.64 
 
 
319 aa  46.2  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  26.98 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  33.06 
 
 
337 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  28.23 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.52 
 
 
757 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0241  hypothetical protein  25.62 
 
 
157 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  24.29 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  25.41 
 
 
1106 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>